近年来，泉州海洋经济发展快速，全市成规模的水产品加工企业107个，年水产品加工能力11.97万吨;水产冷库89座,日冷结能力2.36万吨，日制冰能力2040吨;2011年全市海洋水产业总产量100.62万吨，海洋渔业总产值93亿元，其中海水产品加工业总产值67.9亿元。拥有石狮市单冻牡蛎、组合食品、中上层鱼类及卡拉胶加工，晋江市鱿鱼、鱼片、鱼糜、鱼浆等深加工，泉港区藻类加工及综合利用，惠安县低值小杂鱼和鱼露加工，南安市鱼类异型罐等多种生产能力。
水产加工喜忧参半
泉州市海洋经济总体上呈现持续向好势头，但优势产业主要集中在资源采集的第一产业，二、三产业比重较小。海洋生物医药、海洋可再生能源等产业有待新突破，需要更多有规模的海洋特色产业，并以龙头企业为重点，借助本地海域丰富的生物资源和海洋科技方面的研发基础，重点培育海洋生物医药、海洋保健食品、海洋精细化工等新兴产业。在石狮、泉港等地，明祥水产食品公司与高校、科研单位协作，研发的“海葆”牌天然海藻饮料深受广大消费者喜爱;华宝海洋生物化工有限公司利用蟹虾壳等废弃物，开发生产出25个产品，每年生产出高科技含量的海洋生物保健品约3800吨，产值约3.3亿元。
近年来，石狮市渔业及水产品加工业的发展遇到了一些新的问题，制约了其相关产业的持续、高速发展。首先，由于受海洋资源减少、捕捞成本与风险增加等因素影响，近年来近海渔业生产呈现下滑趋势。其次，石狮目前的养殖品种仍主要以牡蛎、紫菜、贻贝等传统大宗品种为主(其产量和养殖面积比例分别为88.3%和96.7%)，总体附加值较低;现有养殖规模普遍偏小，育种和培养技术落后，高价值水产品产量较低。第三，本地区水产品深加工的原料对国外及省外的依赖程度较高，现有海洋捕捞能力及安全保障支撑水平有待进一步提高;水产品加工仍然以传统的晒干、腌制为主，高科技型深加工企业偏少。第四，医药品原料等较高附加值的深加工水平仍有待开发，现有企业普遍存在规模小、水平低、先进技术的应用推广力度不足等问题，无法满足水产品资源有效利用的要求。因此，在有效整合石狮市渔业及水产业现有资源的基础上，本项目的实施，可望突破上述制约相关产业发展的瓶颈，实现石狮渔业与水产加工业跨越式发展，达到“规模化、集成化、产业化”的总体发展目标。
面对喜忧参半的现状，业内人士提出了泉州市水产加工产业发展对策：加大财政倾斜力度，扶持地方水产品龙头企业发展;构建水产技术创新联盟，增强地区水产加工企业竞争力;促进水产新技术研究，发展产学研项目;加大新技术推广示范，促进海洋高新生物技术企业发展，合理企业间有效竞争;建立水产新产业，摆脱对外依赖;加强水产品质量监督，规范市场行为。
组建联盟意义重大
根据《全国渔业发展第十二个五年规划》，十二五期间，我国渔业要坚定不移地调结构、转方式、保安全、促发展，更加注重资源节约、环境友好，更加注重水产品质量安全，更加注重产业发展的安全保障，更加注重科技创新和推广应用，更加注重渔业的多功能性拓展，更加注重渔民民生问题，更加注重国际竞争力提升，加快推进现代渔业建设。因此，筹建水产品加工产业技术创新战略联盟，有利于全面贯彻国家发展水产业总方针和农业部渔业发展政策导向，有利于促进泉州市渔业产业结构的优化和调整;同时，特色加工技术的开发也有利于实现其向生态渔业模式的转型。
泉州海域水产资源丰富，全市海洋渔场面积达5000多平方千米，已初步形成了较为完整的海洋产业体系。筹建水产品加工产业技术创新战略联盟，有利于充分发挥泉州市在水产品养殖、捕捞以及深加工产业上的传统优势、资源优势、市场优势和生态优势，为泉州市发挥其在渔业生产方面的传统优势提供更为广阔的平台，促进泉州市社会经济发展，为打造海峡西岸蓝色产业带、建设海洋经济强市打下了良好基础。
近年来，随着技术进步的加快和国际竞争的加剧，海洋加工产业面临着技术创新能力不强、产学研脱节、产品附加值低等困扰，整个产业处于相对弱势，依靠技术创新加快产业升级的任务十分迫切。筹建水产品加工及养殖产业技术创新战略联盟，标志着以往各自为营的水产加工企业，将集中优势研发资源抱团攻关，共享技术科技成果，提升综合竞争能力，加快整个产业的转型升级。
通过有效整合泉州市现有科技资源，针对目前水产加工存在的问题，提高泉州地区海洋水产品深加工产业链的技术水平。同时加强水产加工业产学研结合程度，形成良好的科技信息互通机制和培训机制，提升水产品深加工产业化发展的科技含量，并针对当地特色产业科技需求，为进一步提升泉州市水产加工食品的知名度、美誉度和市场竞争力提供了强力支撑，有利于科学有效地调配和组合科技资源，为全市养殖农户、渔民和水产品生产、加工、销售的企业提供强有力的科技支撑及技术服务，并带动整个福建省相关产业的发展。
提高水产品附加值
泉州市海洋生物加工产业技术创新战略联盟由福建省从事海洋生物加工产业的企业、省内外高等院校、科研单位，以及其他组织机构自愿组成。其宗旨是联合泉州市致力于海洋生物技术及水产加工相关产业的企业、省内外高等院校及科研单位，本着“联合开发、优势互补、资源共用、利益共享”的原则，以产业技术创新需求为导向，以攻克和掌握当今海洋生物制品及加工产业的共性、关键、前沿核心技术为目标，构架合理完善、强劲有力的区域性海洋生物制品及水产加工产业链，从而积极推动各联盟单位的技术创新和产业转化，实施抱团发展，产生聚集效应，提升在国内外的行业竞争力，带动区域经济的发展，为建设创新型的海西经济区服务，实现技术制胜、把握未来的海洋生物制品及加工产业发展规划。
泉州市海洋生物加工产业技术创新战略联盟2012年11月-2015年11月的工作目标是——
根据目前泉州水产品加工企业优势，加快低值水产品综合利用水平，提高水产品经济附加值;提高优质水产品深加工技术，开展合成水产食品研究，推广保健水产品和美容水产食品的开发应用研究，形成具有地方特色的、满足市场多样化需求的水产品种;充分利用水产品加工副产品，加强水产品综合利用效率，实现“变废为宝”、和“零排放”的目标。
通过高新生物技术的应用，重点培育海洋生物医药、海洋保健食品、海洋精细化工等新兴产业，注重应用高新科技和酶工程技术，以项目带动海洋生物产业发展。以泉州生物产业基地为载体，重点研发以海洋生物药品、海洋保健食品、功能化妆品、海洋生物标准品等为主导的海洋生物医药战略性新兴产业;建立和逐步完善拥有自主知识产权的海洋药源生物良种培育技术体系，完善海洋生物功能性物质研究开发技术体系，建立海洋功能性脂类、糖类、蛋白类等物质的不同提取技术、制备工艺的关键技术研究开发，以新型生物催化与转化技术、基因工程技术和代谢工程技术为基础，开发海洋功能性脂肪酸、有机酸、天然色素、生物酶、医药中间体等高价值产品。
水产品加工科技信息服务创新体系建立，通过优化并完善现代信息网络平台，建立农村科技信息化示范基地与服务站点，开展面向“三农”的农村科技远程培训，培养生态渔业科技信息服务队伍。同时，依托省内外相关涉海、涉农高校、研究所，长期为本地渔民、养殖户、水产品加工等相关企业提供技术指导，为泉州地区特色水产品加工产业技术的示范与推广提供便捷、及时和强大的业务支撑和技术保障。
结合渔业科技入户工程，实施渔业科技入户培训，结合渔病防治员和水产品质量安全管理员工种鉴定，实施职业技能培训，结合农产品质量安全，实施水产品质量安全培训，结合实用技术应用，实施常规培训;完善泉州市水产科技培训中心，建立泉州地区海洋水产科技专家库;创建海洋生物技术、海洋生物化工研发中心，构建科技成果转化技术平台和产业化中试实验基地。
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